Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A4AQ96JQ5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms