Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VCPIP1Q96JH7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VCPIP1Q96JH7 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms