Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC34Q96HJ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC34Q96HJ3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms