Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RNF185Q96GF1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RNF185Q96GF1 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms