Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DDX11Q96FC9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms