Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES6

MFSD3, Major facilitator superfamily domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD3Q96ES6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MFSD3Q96ES6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MFSD3Q96ES6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms