Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM44Q96DX7 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM44Q96DX7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms