Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FAF2Q96CS3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FAF2Q96CS3 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms