Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RFKQ969G6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms