Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERCC4Q92889 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERCC4Q92889 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms