Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FRAT1Q92837 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FRAT1Q92837 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms