Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
CTTNBP2Q8WZ74 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
CTTNBP2Q8WZ74 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms