Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RUFY2Q8WXA3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RUFY2Q8WXA3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms