Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV19

SFT2D1, Vesicle transport protein SFT2A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1Q8WV19 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SFT2D1Q8WV19 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SFT2D1Q8WV19 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms