Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ZNF398Q8TD17 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNF398Q8TD17 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms