Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEF3

CCDC112, Coiled-coil domain-containing protein 112, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC112Q8NEF3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC112Q8NEF3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms