Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDG6

TDRD9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD9Q8NDG6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
TDRD9Q8NDG6 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.76■■■■□ 3
TDRD9Q8NDG6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms