Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z2

CCDC71L, Coiled-coil domain-containing protein 71L, humanhuman

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71LQ8N9Z2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CCDC71LQ8N9Z2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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