Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MSL3Q8N5Y2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MSL3Q8N5Y2 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms