Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GPC2Q8N158 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GPC2Q8N158 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.6 ms