Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HACE1Q8IYU2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HACE1Q8IYU2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms