Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C9orf40Q8IXQ3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
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C9orf40Q8IXQ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C9orf40Q8IXQ3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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