Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NPAS3Q8IXF0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms