Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVB4

SLC9A9, Sodium/hydrogen exchanger 9, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A9Q8IVB4 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC9A9Q8IVB4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9A9Q8IVB4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms