Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NME9Q86XW9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NME9Q86XW9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NME9Q86XW9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NME9Q86XW9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
NME9Q86XW9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME9Q86XW9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms