Protein–RNA interactions for Protein: Q86VB7

CD163, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M130, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163Q86VB7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CD163Q86VB7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CD163Q86VB7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms