Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLRX1Q86UT6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLRX1Q86UT6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms