Protein–RNA interactions for Protein: Q71UI9

H2AFV, Histone H2A.V, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFVQ71UI9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
H2AFVQ71UI9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
H2AFVQ71UI9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms