Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms