Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q6P435 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Q6P435 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Q6P435 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Q6P435 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Q6P435 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Q6P435 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms