Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC27A4Q6P1M0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms