Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
NEPROQ6NW34 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NEPROQ6NW34 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms