Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
APOBEC3HQ6NTF7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APOBEC3HQ6NTF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms