Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NANOGP8Q6NSW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms