Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD40Q6AI12 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ANKRD40Q6AI12 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms