Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ATG16L1Q676U5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms