Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USPL1Q5W0Q7 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USPL1Q5W0Q7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms