Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDE4DIPQ5VU43 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PDE4DIPQ5VU43 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms