Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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GFI1BQ5VTD9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GFI1BQ5VTD9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GFI1BQ5VTD9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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GFI1BQ5VTD9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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GFI1BQ5VTD9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GFI1BQ5VTD9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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GFI1BQ5VTD9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GFI1BQ5VTD9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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