Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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COL5A1-AS1Q5SY13 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COL5A1-AS1Q5SY13 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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