Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
COLEC12Q5KU26 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
COLEC12Q5KU26 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms