Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC27A3Q5K4L6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC27A3Q5K4L6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms