Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FRMPD3Q5JV73 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FRMPD3Q5JV73 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms