Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BRDTQ58F21 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms