Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP221Q4G0U5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP221Q4G0U5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms