Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Q1T7F1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Q1T7F1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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