Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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