Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SGCAQ16586 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SGCAQ16586 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SGCAQ16586 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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SGCAQ16586 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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SGCAQ16586 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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