Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRIK5Q16478 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIK5Q16478 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms