Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
E2F4Q16254 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
E2F4Q16254 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms